中国学者再次发表关于NgAgo的学术文章

2019-06-09 08:32:28 来源: 漯河信息港

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文章显示,研究团队在斑马鱼的细胞中使用NgAgo基因技术后,斑马鱼的眼睛发育出现缺陷,疑似发生了基因。但是进行测序后才发现,基因组层面上或者说DNA层面上,没发生任何。

说明了什么?

“从基因的角度上来看,这(注:指的是通过NgAgo技术看到突变的表型)是一个假阳性。”研究人员还表示,由于研究对象不同,此次研究“不能对此前韩春雨的结论证实或证伪”。

新/闻/背/景

基因技术无法重复

13位中国同行呼吁调查

今年5月,河北科技大学韩春雨团队在《自然·生物技术》的论文中报告说,他们发明了新的基因技术NgAgo-gDNA。

这篇论文一经发表便引起全球生物学界巨大关注,因为基因是当前的热门领域,主流技术是美国科研人员的CRISPR-Cas9技术。而根据论文,NgAgo-gDNA技术与CRISPR-Cas9技术相比在一些方面具有优势。

但随后中国以及国外都有学者公开表示无法重复论文中描述的实验,这项研究成果遭到多方质疑。《自然·生物技术》目前仍在继续调查这一事件,尚未做出进一步的决定。

10月10日,包括王皓毅、杨辉在内的13位中国生物学家实名发声,表示在对NgAgo技术多次进行重复实验或验证后,无法支持韩春雨的结果,呼吁有关部门启动学术调查。

中国南通大学等机构研究人员在11日出版的新一期英国《自然》杂志子刊《细胞研究》上发文,报告了他们将NgAgo基因技术用于斑马鱼的研究结果。

今年5月河北科技大学韩春雨团队在《自然》杂志子刊《自然·生物技术》上首次发表关于NgAgo基因技术的论文,并引发轰动和争议。这是自那之后,中国研究人员发表的有关NgAgo基因技术的第二篇学术文章。

“敲低”≠“”

斑马鱼眼部发育有缺陷

但DNA层面未被“”

此文由南通大学和复旦大学研究人员合作完成。通讯作者、南通大学神经再生重点实验室副教授刘东对新华社介绍说,在这项研究中,研究人员将NgAgo基因技术用于改变斑马鱼的基因fabp11a。结果发现,这可以“敲低”该基因,并因此导致斑马鱼眼部发育缺陷。

据《细胞研究》发表的内容显示,该研究的通讯作者是南通大学神经再生重点实验室副教授刘东,研究团队人员除了来自南通大学,还包括复旦大学生命科学学院研究员王永明。

该文章显示,研究团队在斑马鱼的细胞中使用NgAgo技术后,斑马鱼的眼睛发育出现了缺陷,疑似发生了基因。但是进行测序后才发现,基因组层面上或者说DNA层面上,没发生任何。进一步,他们检测发现,只是mRNA表达量上发生了改变。这意味着引起发育缺陷的原因是基因敲低。

但是在学术上,“敲低”基因并不等于“”基因,这项研究并没有发现NgAgo技术有基因功能。

“信”≠“论文”

要对NgAgo技术作出评价

还需要等待更多研究结果

研究人员表示,由于研究对象不同,此次研究“不能对此前韩春雨的结论证实或证伪”。

刘东对说,他们此次的研究在斑马鱼模型上没有发现NgAgo技术有基因功能,“但并不能支持或者反驳此前韩春雨的实验结果。”

此外,文章的作者之一王永明接受媒体采访时解释,消息,这次发在《细胞研究》上的文章属于“Letter(信)”,并非“Article(论文)”,这也是他们选择向《细胞研究》而不是《自然》系列期刊投稿的原因。

“因为当时我们做出来的结果不多,所以在《细胞研究》上有那种letter性质的文章,只需要一个数据图,需要的结果比较少。所以我们觉得发在这上面更适合。如果你要想发在《自然》系列上的话,需要做好几个数据图,需要大量的工作,所以我们觉得投在这上面比较合适一点。”王永明说。

就此联系了韩春雨,但未获正式回复。

北京大学生物学家饶毅教授就此表示,要对NgAgo技术作出评价,还需要等待更多的研究结果。

提问

什么是基因敲低

什么是基因

这要从生命体的运转流程说起。DNA是负责引导生物发育与生命机能运作的“司令”,但具体的生物功能都由蛋白质来执行。所以,DNA需要先转录成为RNA,再通过RNA翻译成蛋白质。这个过程称为基因表达,其中,RNA充当了中介的角色。

如果通过人为的方式,对RNA这个中介进行干扰,使得基因表达降低,只能完成一小部分的基因表达,让蛋白质无法正常工作,我们就将这一现象称为“基因敲低”。

如果是对DNA这个发号“司令”进行变动,使得基因的序列发生变化,那是更高级别的干预,会完全改变基因表达,我们称为“基因”。

韩春雨在5月2日发表的论文认为,NgAgo技术可以实现“基因”,而刘东等人的这篇文章提供的结论是,NgAgo技术并没有实现“基因”,实现的是“基因敲低”或者说“基因表达降低”。

回答

结论意味着什么

是支持还是反驳

11月11日联系上文章的作者之一王永明,他告诉,他们的研究结果是发现了NgAgo的另外一个功能,并含蓄地表示:“我们的结果并没有支持或者反驳韩春雨教授的结果。”王永明解释道:韩春雨的论文是在哺乳动物(人)的细胞里做实验,而他们是在斑马鱼里做,属于两个系统,做法上也有差别,是两个不一样的实验。

今年6月,就在韩春雨发表论文后一个月,王永明和合作者就开始研究NgAgo技术,在大约做了一个月时间的实验后,他们发现了NgAgo这个不同于“基因”的特性。

“结果刚出来的时候还没有质疑声,他在这么高水平的杂志上发表了文章,我们很想拿过来用一下,用完之后我们确实在鱼身上看到了‘表型’,所以我们很高兴,觉得在鱼里面确实能基因。然后我们就进一步研究,想看看完后DNA上有啥改变。但是一检查发表DNA上没有改变。然后我们又检测了RNA,发现RNA的表达下调了。所以基于这个结果,我们就做了这篇文章。”

王永明说,“从基因的角度上来看,这(注:指的是通过NgAgo技术看到突变的表型)是一个假阳性。”

对于为何NgAgo有基因表达降低的功能,该研究团队在文章里提出猜想:NgAgo是通过结合到目标基因上,阻止了基因转录成RNA,无法翻译成蛋白,使得基因的功能发挥不出来。

中科院动物研究所研究员王皓毅、中科院上海生科院神经科学研究所研究员杨辉看完文章后表示,这篇文章与他们之前的实验结论并不矛盾,也没有检测到基因组的定点突变,但是对于使用NgAgo技术会出现基因表达降低这一现象,文章虽然对此提出了可能的机制,但没有更深一步的探讨。

据新华社、东方早报等

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